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截至2014年4月，學校有省部級重點學科4個，省哲學社會科學重點建設學科1個。有一級學科碩士學位授權點11個、二級學科碩士學位授權點30個。
省部級重點學科4個：水產(chǎn)學、水生生物學、動物遺傳育種與繁殖、水產(chǎn)養(yǎng)殖。 
省哲學社會科學重點建設學科1個：思想政治教育。 
一級碩士點11個：水產(chǎn)學科、海洋科學、生物學、生態(tài)學、生物醫(yī)學工程、農(nóng)業(yè)工程、水利工程、食品科學與工程、計算科學與技術、軟件工程、工商管理。
教學建設
截至2014年3月，大連海洋大學有1個國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)，1個國家級實驗教學示范中心，1個國家級校外教學實踐基地、2個省級實驗教學示范中心，2個省級實踐教育基地建設項目，3個國家級特色專業(yè)，1個遼寧省緊缺本科人才培養(yǎng)基地。國家級精品課程1個，省級精品課程11個。
國家級實驗教學示范中心1個：水產(chǎn)養(yǎng)殖學實驗教學中心。
省級實驗教學示范中心2個：物理實驗教學中心，經(jīng)濟管理實驗教學中心 。
國家級精品課程1個：水生生物學?！?br /> 省級精品課程11個：水生生物學，軟件基礎系列課，物理，航海技術系列課，養(yǎng)殖水環(huán)境化學，大學英語，水產(chǎn)動物生理學，材料力學，計算機技術基礎，貝類學，光學 。
國家級特色專業(yè)3個：水產(chǎn)養(yǎng)殖、水生生物學、港口航道與海岸工程。