預(yù)防獸醫(yī)學(xué)，為國家重點(diǎn)學(xué)科、博士學(xué)位和碩士學(xué)位授予點(diǎn)，由我國現(xiàn)代獸醫(yī)教育的奠基人之一羅清生教授創(chuàng)建。國際動物衛(wèi)生組織豬鏈球菌病參考實(shí)驗(yàn)室、農(nóng)業(yè)部動物細(xì)菌學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、江蘇省動物免疫工程實(shí)驗(yàn)室掛靠在本學(xué)科。本學(xué)科由獸醫(yī)微生物學(xué)與免疫學(xué)、家畜傳染病學(xué)和動物寄生蟲學(xué)三個學(xué)科組組成。長期以來，本學(xué)科立足學(xué)科發(fā)展前沿和我國畜牧獸醫(yī)事業(yè)發(fā)展的現(xiàn)實(shí)需求，凝練學(xué)科方向，拓展研究內(nèi)容，形成了分子病毒與免疫學(xué)、病原與宿主相互作用、動物傳染病發(fā)病機(jī)制和免疫、獸醫(yī)微生物致病機(jī)理及免疫、獸醫(yī)寄生蟲分子免疫學(xué)、獸醫(yī)公共衛(wèi)生等六個特色鮮明的研究生培養(yǎng)方向。圍繞這些方向，在畜禽傳染病的病毒、細(xì)菌、感染性免疫等領(lǐng)域取得了系列基礎(chǔ)研究成果。成功研制出豬鏈球菌疫苗、豬繁殖與呼吸綜合癥弱毒疫苗、豬圓環(huán)病毒滅活疫苗等防控產(chǎn)品，為動物疫病防控、獸醫(yī)臨床診療和畜禽健康生產(chǎn)做出了貢獻(xiàn)。
現(xiàn)有固定教職工44人，其中教授19名，副教授和高級實(shí)驗(yàn)師12名、講師和實(shí)驗(yàn)師8名。全國農(nóng)業(yè)科研杰出人才和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)2個，江蘇省特聘教授1名，江蘇省“333”工程學(xué)術(shù)人才（第二層次）1名，國家基金優(yōu)青項(xiàng)目1名，教育部新世紀(jì)優(yōu)秀學(xué)術(shù)人才4名，南京農(nóng)業(yè)大學(xué)鐘山學(xué)術(shù)新秀3名。承擔(dān)《獸醫(yī)微生物學(xué)》、《獸醫(yī)免疫學(xué)》、《獸醫(yī)傳染病學(xué)》、《獸醫(yī)寄生蟲病學(xué)》、《獸醫(yī)生物制品學(xué)》、《動物性食品衛(wèi)生學(xué)》、《獸醫(yī)流行病學(xué)》、《畜牧微生物學(xué)》、《水產(chǎn)微生物學(xué)》、《動物保護(hù)學(xué)》等本科生課程及《現(xiàn)代動物免疫學(xué)》、《基因工程原理與方法》和《現(xiàn)代疫苗學(xué)》等研究生課程，設(shè)有1個預(yù)防獸醫(yī)學(xué)本科生教學(xué)實(shí)驗(yàn)中心，15個本科生實(shí)習(xí)基地?，F(xiàn)有豬鏈球菌病OIE參考實(shí)驗(yàn)室，農(nóng)業(yè)部動物細(xì)菌學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室（原名：動物疫病診斷與免疫重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室），3個校級研究室（動物疫苗創(chuàng)制中心、魚病漁藥研究室、獸醫(yī)寄生蟲病研究室）。近五年承擔(dān)國家和部省級課題80多項(xiàng)，科研經(jīng)費(fèi)累計(jì)8500余萬元，發(fā)表研究論文530余篇，其中SCI論文250余篇，獲發(fā)明專利8項(xiàng)，國家新獸藥注冊證書1個，獲部省級科技成果獎4項(xiàng)。2005年“豬鏈球菌病防控技術(shù)”獲國家科技進(jìn)步二等獎。與德國、美國和加拿大等國際合作交流合作密切。主編《獸醫(yī)傳染病學(xué)》（第六版）、《獸醫(yī)微生物學(xué)》（第五版）、《動物保護(hù)學(xué)概論》和《獸醫(yī)生物制品學(xué)》（第三版）等全國統(tǒng)編教材4部，出版專著10部。