北京協(xié)和醫(yī)學院基礎學院生物醫(yī)學工程學系介紹 正文

學系簡介：生物醫(yī)學工程學是綜合應用生命科學與工程科學的原理和方法，在集成材料學、化學、物理學、數(shù)學和計算科學等多學科知識的基礎上，從工程學角度在分子、細胞、組織、器官乃至整個人體系統(tǒng)多層次認識人體的結構、功能和其他生命現(xiàn)象，研究用于疾病診斷和治療、人體功能康復以及衛(wèi)生保健的生物醫(yī)用材料、醫(yī)藥制劑、醫(yī)學器件、裝置與設備等技術的學科。
北京協(xié)和醫(yī)學院基礎學院生物醫(yī)學工程系是我國生物醫(yī)學工程學科的發(fā)祥地，其前身是1978年由中國醫(yī)學科學院時任院長黃家駟教授發(fā)起并建立的生物醫(yī)學工程研究室。學系于1996年獲得教育部博士學位授權點資格，并設有博士后科研流動站。
建系以來學系始終堅持多學科交叉和與臨床醫(yī)學應用緊密結合的發(fā)展理念，上世紀八、九十年代在國家科技部科技攻關項目、國家自然基金重點項目、及衛(wèi)生部和民政部等部委項目的支持下，開展了人工心臟和心血管系統(tǒng)介入醫(yī)療器件、連續(xù)腹膜透析裝置、大輸液用包裝袋多層復合膜材料、阻抗檢測、人工耳蝸等技術的研發(fā)；2000年以來，增加了納米生物醫(yī)學技術和生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫建設等學科方向；2010年以來，通過整合資源和引進人才，聚焦于三個方向的建設，包括（1）生物材料和納米技術：開展基于生物材料的藥物遞送系統(tǒng)、組織工程與再生醫(yī)學、檢測與診斷技術、及納米技術標準化等研究；（2）生物信息學方向：開展計算生物學和系統(tǒng)生物學研究、生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)深度挖掘以及生物分子網(wǎng)絡模建；（3）醫(yī)學影像和醫(yī)學圖像分析：研發(fā)適應現(xiàn)代醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)特點的計算機視覺、機器學習、人工智能圖像識別方法和應用技術。學系人員承擔的科研項目包括國家重點研發(fā)專項、國家重大科學研究納米計劃項目（973）、科技部重大國際合作項目、國家自然科學基金重大項目、重點項目及面上和青年項目、北京市自然科學基金、中國醫(yī)學科學院醫(yī)學創(chuàng)新重點項目和協(xié)同創(chuàng)新項目等。
學系歷任主任包括楊子彬教授（1978-1990）、余玨教授（1990-1995）、張正國教授（1995-2009），現(xiàn)任主任為許海燕教授（2009-）。截止目前在職職工12人，包括正高級職稱4人（許海燕、蔣太交、彭屹、劉?。?、副高級職稱5人（孟潔、張唯唯、楊嘯林、張衛(wèi)奇、孔樺）、中級職稱2人（王志剛、溫濤）、初級職稱1人（趙成），其中博士生導師3人、碩士生導師4人。學系現(xiàn)有四個課題組（許海燕、蔣太交、張唯唯、張衛(wèi)奇）。
在教學和研究生培養(yǎng)方面，建立了面向博士和碩士研究生等高層次人才培養(yǎng)為主體的科研與教學體系。學系自1988年以來一直為八年制臨床醫(yī)學專業(yè)本科生開設《生物醫(yī)學工程學》課程，2019年開始為4+4臨床醫(yī)學試點班開設《生物醫(yī)學工程學》選修課。此外，開設研究生課程《生物醫(yī)學工程概論》、《納米醫(yī)學概論》、《應用生物信息學》、《電子技術在生物醫(yī)學中的應用》、《生理學物理分析》、和《計算機應用基礎》，并承擔了繼續(xù)教育學院的《醫(yī)學物理》課程。學系每年招收的研究生來自全國不同高校，本科專業(yè)背景涉及生命科學、材料學、化學、藥學、基礎或臨床醫(yī)學等相關專業(yè)，學系努力為研究生們提供優(yōu)良的研究條件和交流平臺，使各類不同專業(yè)背景的學生能夠充分發(fā)揮其學術研究潛力。研究生多人次先后獲得國家獎學金、光華獎學金、及院校一等獎學金，在專業(yè)領域高影響力學術雜志發(fā)表研究論文。建系以來已培養(yǎng)畢業(yè)生超過百名，工作單位包括高等學校、科研院所、各部委所屬事業(yè)單位、國際知名醫(yī)藥公司、以及美國和香港地區(qū)等大學的博士后等。
 
歷屆主任：
楊子彬，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所教授、博士生導師，1978-1990年任基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程系主任。1952年畢業(yè)于白求恩醫(yī)科大學（原第三軍醫(yī)大學）醫(yī)學系，1962年畢業(yè)于北京郵電學院函大無線電系。1953-1977年在中國協(xié)和醫(yī)科大學北京協(xié)和醫(yī)院歷任內科、外科、住院醫(yī)師、主治醫(yī)師，理療科主任。1978年進入中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所，曾任研究所副所長。1981-1982 年在Texas Heart Institute做訪問學者。
楊子彬教授是中國生物醫(yī)學工程學會的創(chuàng)始人和學術帶頭人之一；在國際上曾任國際生物醫(yī)學工程聯(lián)合會執(zhí)委及亞太地區(qū)工作委員會委員、第二屆亞太地區(qū)生物醫(yī)學工程學術大會主席、國際生物醫(yī)學工程聯(lián)合會（IFMBE）執(zhí)行局常務委員。2002年被授予國際生物醫(yī)學工程科學院（International Academy of Medical and Biological Engineering, IAMBE）Fellow稱號，并當選為該院執(zhí)行局常委。在國內曾任中國生物醫(yī)學工程學會副理事長兼秘書長、國家醫(yī)療器械專家委員會副主任、國家發(fā)明獎和科技進步獎評審委員會委員、北京市人民政府科技顧問。目前擔任中國生物醫(yī)學工程學報（英文版）副主編、國家自然基金生命科學部專家咨詢委員、中國醫(yī)師協(xié)會學術委員會委員、中國科學技術協(xié)會第四屆和第五屆全委會委員等社會職務。
楊子彬教授具有臨床醫(yī)學和電子工程專業(yè)雙學歷背景，他領導的課題組先后研制成功微型冷光紫外線治療機等多種治療儀器。在美國做訪問學者期間從事人工心臟研究，參與了D. J. Cooley全人工心臟植入人體的手術研究工作，被授予Dr. Cooley獎。回國后在我國開創(chuàng)了人工心臟、主動脈內氣囊反搏（IABP）技術、腎功能衰竭尿毒癥CCPD系統(tǒng)的研究；先后承擔國家“七五”、“八五”、“九五”攻關以及國家自然基金重點項目，開展介入性診療器械用血液相容性生物材料和大輸液包裝袋用多層復合膜的研制工作。在教學工作中，指導研究生的科研和承擔醫(yī)大八年制臨床醫(yī)學專業(yè)《生物醫(yī)學工程》的授課任務。發(fā)表科學論文100余篇，編著、合著生物醫(yī)學工程相關專著五本，曾獲衛(wèi)生部全國科技大會獎、天津市科技成果獎和醫(yī)科院科技成果獎，取得五項國家發(fā)明專利。
余玨，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所教授，1991-1995年任生物醫(yī)學工程系主任。1962年畢業(yè)于莫斯科動力學院。1963-1980年在上海交通大學電機系和應用化學系工作，歷任助教、講師、副教授。1981-1983年被聘為中國科學院化學研究所訪問合作教授。1984-1999年在中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學院生物醫(yī)學工程學系工作，歷任副教授、教授。曾任中國生物醫(yī)學工程學會理事、中國生物電磁學專業(yè)委員會副主任委員、北京生物醫(yī)學工程學會理事。
余玨教授在上海交通大學電機系工作期間從事電工材料和電氣絕緣的教學與研究，并任教研室的黨支部書記?；謴透呖己?，參與編寫與整理專業(yè)教材和科研培訓資料，為該校該專業(yè)領域進入正常教學科研軌道做出了貢獻，連續(xù)三年被評為先進工作者。1979年院系調整后，該專業(yè)的一部分成為應用化學系高分子材料科學專業(yè)，余老師從此開始涉及生物介質物理研究領域；1981-1983年作為訪問合作教授到中國科學院化學研究所，在所長錢人元院士領導的高分子物理研究室從事有機固體電導和光導的應用基礎研究，開創(chuàng)了一種研究高分子熱電性能的新方法，成果發(fā)表在1985年的高分子學報上。
1984年調入中國醫(yī)學科學院，從事醫(yī)學物理和生物電性的教學與科研工作。在交通部和衛(wèi)生部基金資助下進行了東莨菪堿緩釋止暈貼片的研制開發(fā)，在國內較早地成功開發(fā)出經(jīng)皮緩釋給藥的制劑，在藥物釋放和藥效控制等方面有先進的研究成果，獲交通部科技進步二等獎和醫(yī)科院科研三等獎，研制產(chǎn)品得到國家藥監(jiān)局的生產(chǎn)許可證書，技術成果被轉讓給專業(yè)藥廠。在國家自然科學基金和衛(wèi)生部基金資助下，余玨教授開展了生物細胞和組織的介電性能研究，其中有關紅細胞介電、人胎兒器官組織介電的二篇論文發(fā)表在美國“生物電磁學”期刊上；一篇關于人腦膠質瘤和周圍組織介電的論文發(fā)表在英國“國際高溫雜志”上，其他研究結果發(fā)表在《中國生物醫(yī)學工程學報》、《動物學報》、《基礎醫(yī)學與臨床》等核心期刊。余玨教授關于“生物細胞和組織的介電性能研究”的成果于1995年獲得衛(wèi)生部科技進步二等獎。此外，余老師還帶領課題組開展了用克爾電光效應技術研究DNA 微觀力學性質的研究。余玨教授承擔的衛(wèi)生部科研項目“生物電阻抗人體體液測定儀”，實現(xiàn)了在人體表面無創(chuàng)測定體內細胞外液含量的功能，在一定程度上反映循環(huán)系統(tǒng)的功能和新陳代謝的能力，對于了解人體的生理和臨床狀態(tài)，實現(xiàn)對水腫的定量檢測、對循環(huán)系統(tǒng)疾病進行輔助診斷有重要意義。研制的樣機已分別在協(xié)和醫(yī)院和友誼醫(yī)院的血液透析中心進行了臨床試驗應用。該技術成果向國家知識產(chǎn)權局申報了發(fā)明專利。在研究工作之外，余老師還承擔了協(xié)和醫(yī)科大學八年制醫(yī)學本科生和研究生的教學工作，所編寫的教材《醫(yī)用電子學》和《生理學的物理分析》被評為優(yōu)秀教材。
陳仁塙，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所副研究員。1945年畢業(yè)于北平燕京大學經(jīng)濟系，曾任中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程室副主任（主持工作）；中國醫(yī)學科學院第一屆學術委員會委員及基礎醫(yī)學研究所第二屆學術委員會委員；中國電子學會生物醫(yī)學電子分會委員；《電子學報》編委；中國生物醫(yī)學工程學會第一屆副秘書長；《中國生物醫(yī)學工程學報》第一屆主編（創(chuàng)刊人）；深圳市生物醫(yī)學工程學會顧問；《中國醫(yī)學科學院年鑒》編委；《醫(yī)學大百科全書》生物醫(yī)學工程第一章的撰稿人。
曾帶領團隊研制了國內臨床急需的電子儀器，包括：X-線外照射劑量標準測量儀、蓋革計數(shù)定標儀、閃爍掃描器（國內自制第一臺）、閃爍計數(shù)器和計數(shù)率儀。1957 年協(xié)同協(xié)和醫(yī)院放射科創(chuàng)辦“同位素治療室”。1958年于北京、天津、上海、廣州開辦“同位素培訓班”，負責“放射性同位素物理”、“核儀器”、“射線探測”等課程教學和實驗，為國內各醫(yī)院建立同位素治療奠定了基礎。
1961年調中國醫(yī)學科學院儀器研究所任第三室主任，主要科研成果包括：放射腎圖儀（定型為SF-121型，圖紙無償交有關工廠生產(chǎn)400余臺）、γ譜儀（對Cs137能量分辨率達70%；全身閃爍掃描器（圖紙無償交有關工廠投產(chǎn)，定型為SX-1和MS-3X型，生產(chǎn)約400余臺）、中能高分辨準直器（為上海醫(yī)療器械研究所FTS-203型彩色掃描器中配套使用）、功能測定儀用準直器（為北京醫(yī)療儀器廠BYF-15型動態(tài)功能測定儀配套使用）。
1978年調入中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程研究室任副主任，主持人工耳蝸研究。1981年研制成功“人工單導感應式電子耳蝸”，在臨床多例手術中獲得成功，獲衛(wèi)生部科研甲級一等獎并獲國家專利局批準專利權。1983 年進一步研制“人工多導感應式環(huán)型及球型電子耳蝸”，獲衛(wèi)生部科研乙級成果獎。在刺激信號方面研究試行幾種不同語言編碼，應用于臨床取得較好成果。
林金森，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所研究員，博士生導師；1979-2000年任生物醫(yī)學工程學系（室）黨支部書記。一直從事人工耳蝸研究，負責聽神經(jīng)電刺激裝置的研制和人工耳蝸課題的研究，還領導了耳聲發(fā)射檢測設備與方法以及耳聲發(fā)射機理的研究。1983年插座式人工耳蝸的研究獲衛(wèi)生部二等甲級科研成果獎（集體獎）；單導感應式人工耳蝸的研究于1985年獲衛(wèi)生部乙級科研成果獎（集體獎）；非植入式人工耳蝸的研究于1987年獲民政部科技進步二等獎并獲在民政系統(tǒng)科技進步工作中做出重大貢獻獎。單導感應式人工耳蝸是基礎所獲得的第一個發(fā)明專利，非植入式人工耳蝸技術則是基礎所實施的第一次技術轉讓。此外，林金森教授還領導了雙通道語訓設備、調頻語訓設備和可視語訓設備等聽力康復設備的研制，主持了聽力語言康復教材的編寫，主持起草了無線傳輸聾兒語訓設備技術規(guī)范國家標準。
張正國，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所研究員、博士生導師。1996-2009年任生物醫(yī)學工程系主任。1985年畢業(yè)于中國協(xié)和醫(yī)科大學生物醫(yī)學工程系，獲醫(yī)學碩士學位。1989-1990年在美國加州大學舊金山分校醫(yī)學院作博士后，1995-1996年在美國愛荷華大學醫(yī)學院作高級訪問學者。承擔課題包括科技部重點項目“中國生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫－數(shù)據(jù)庫建設子課題”和“中國人生理常數(shù)數(shù)據(jù)庫－數(shù)據(jù)庫建設子課題”、中華醫(yī)學基金項目“建立協(xié)和醫(yī)大知識發(fā)現(xiàn)中心”、國家自然科學基金項目“家兔心室纖顫和心電混沌進程的關系”等。2005年被評為院校優(yōu)秀教師。曾擔任中國生物醫(yī)學工程學會常務副秘書長、教育部生物醫(yī)學工程專業(yè)教學指導委員會委員。
許海燕，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所研究員、博士生導師。2006年任中國醫(yī)學科學院納米生物醫(yī)學聯(lián)合研究中心主任；2009年任生物醫(yī)學工程系副主任（主持工作），2011年任學系主任。本科和研究生均畢業(yè)于中國科學技術大學應用化學系，于1985年和1988年分獲理學學士和理學碩士學位。1994年由JICA項目資助在日本大阪市工業(yè)技術研究所有機學部進修；1999-2000年在美國匹茲堡大學醫(yī)學院McGowan Center for Artificial Organs的William R. Wagner教授實驗室進行血管內皮損傷的抗凝血研究（Visiting Research Associate Professor）。
主要從事生物材料和納米醫(yī)學研究，主要包括：（1）利用納米材料物理學性質構建生物材料支架，調控創(chuàng)傷免疫微環(huán)境和引導組織再生；（2）基于納米技術的抗腫瘤藥物研發(fā)，包括白血病耐藥相關蛋白的拮抗多肽篩選及分子機制、天然藥物新劑型、納米免疫佐劑等；（3）納米材料毒理學及納米技術標準化。現(xiàn)擔任國家重點研發(fā)專項“鐵基納米材料類酶效應與急性髓系白血病診療技術”的項目負責人、中國醫(yī)學科學院醫(yī)學與健康科技創(chuàng)新工程 “納米醫(yī)學在血液系統(tǒng)惡性腫瘤方面的應用” 團隊項目首席科學家、以及國家自然科學基金項目負責人。曾擔任國家重大科學研究計劃納米專項 “生物醫(yī)學納米材料對細胞作用研究”和“生物醫(yī)學納米材料對血細胞作用的研究”項目的課題負責人和項目首席科學家助理；并先后主持完成了多項國家自然科學基金項目和北京自然科學基金項目。
研究成果發(fā)表在生物材料、納米技術、毒理學等領域高影響力學術期刊；申請和擁有多項發(fā)明專利；牽頭制定了3項國家標準。在國家科學技術學術著作出版基金支持下作為共同主編出版《納米生物技術》，在國家出版基金資助下編著出版《納米生物醫(yī)藥載體》和共同主編出版《納米材料對細胞作用》。
在教學方面，擔任北京協(xié)和醫(yī)學院八年制臨床醫(yī)學專業(yè)《生物醫(yī)學工程》和研究生院《納米醫(yī)學概論》兩門課程的負責人，同時承擔研究生《生理學的物理分析》、《生物醫(yī)學工程概論》和《心血管生理學：基礎與臨床》的部分授課任務。
目前擔任中國生物醫(yī)學工程學會理事和納米醫(yī)學與工程分會候任主任委員、中國生物物理學會理事和納米生物學分會委員、全國納米技術標準化委員會委員和“健康、安全和環(huán)境工作組” 秘書長、中國微米納米技術學會納米科學技術分會常務理事、及北京生物醫(yī)學工程學會常務理事。擔任《中國生物醫(yī)學工程學報》、《北京生物醫(yī)學工程》和《國際生物醫(yī)學工程雜志》的編輯委員會委員。
 
各課題組科研工作簡介（詳細信息見課題組鏈接）：
一、許海燕課題組
1. 課題組簡介
本課題組以材料與生物系統(tǒng)界面相互作用為核心，聚焦納米材料生物學效應在腫瘤診療中的應用基礎研究、納米結構和理化特性調控創(chuàng)傷微環(huán)境及引導組織再生研究、以及納米材料毒理學評價方法與標準化技術研究。主要研究方向包括：（1）基于納米技術的抗腫瘤藥物研發(fā)，包括白血病耐藥相關蛋白的拮抗多肽篩選及分子機制、天然藥物新劑型、納米免疫佐劑等；（2）藥物/基因遞送系統(tǒng)和納米檢測技術；（3）利用納米材料物理學性質構建生物材料支架，調控創(chuàng)傷免疫微環(huán)境和引導組織再生；（4）納米材料毒理學及納米技術標準化。
2. 課題組負責人介紹
2006年任中國醫(yī)學科學院納米生物醫(yī)學聯(lián)合研究中心主任；2009年任生物醫(yī)學工程系副主任（主持工作），2011年任學系主任。本科和研究生均畢業(yè)于中國科學技術大學應用化學系，于1985年和1988年分獲理學學士和理學碩士學位。1994年由JICA項目資助在日本大阪市工業(yè)技術研究所有機學部進修；1999-2000年在美國匹茲堡大學醫(yī)學院McGowan Center for Artificial Organs的William R. Wagner教授實驗室進行血管內皮損傷的抗凝血研究（Visiting Research Associate Professor）。
主要從事生物材料和納米醫(yī)學研究，主要包括：（1）利用納米材料物理學性質構建生物材料支架，調控創(chuàng)傷免疫微環(huán)境和引導組織再生；（2）基于納米技術的抗腫瘤藥物研發(fā)，包括白血病耐藥相關蛋白的拮抗多肽篩選及分子機制、天然藥物新劑型、納米免疫佐劑等；（3）納米材料毒理學及納米技術標準化?，F(xiàn)擔任國家重點研發(fā)專項“鐵基納米材料類酶效應與急性髓系白血病診療技術”的項目負責人、中國醫(yī)學科學院醫(yī)學與健康科技創(chuàng)新工程 “納米醫(yī)學在血液系統(tǒng)惡性腫瘤方面的應用” 團隊項目首席科學家、以及國家自然科學基金項目負責人。曾擔任國家重大科學研究計劃納米專項 “生物醫(yī)學納米材料對細胞作用研究”和“生物醫(yī)學納米材料對血細胞作用的研究”項目的課題負責人和項目首席科學家助理；并先后主持完成了多項國家自然科學基金項目和北京自然科學基金項目。
研究成果發(fā)表在生物材料、納米技術、毒理學等領域高影響力學術期刊；申請和擁有多項發(fā)明專利；牽頭制定了3項國家標準。在國家科學技術學術著作出版基金支持下作為共同主編出版《納米生物技術》，在國家出版基金資助下編著出版《納米生物醫(yī)藥載體》和共同主編出版《納米材料對細胞作用》。
在教學方面，擔任北京協(xié)和醫(yī)學院八年制臨床醫(yī)學專業(yè)《生物醫(yī)學工程》和研究生院《納米醫(yī)學概論》兩門課程的負責人，同時承擔研究生《生理學的物理分析》、《生物醫(yī)學工程概論》和《心血管生理學：基礎與臨床》的部分授課任務。
目前擔任中國生物醫(yī)學工程學會理事和納米醫(yī)學與工程分會候任主任委員、中國生物物理學會理事和納米生物學分會委員、全國納米技術標準化委員會委員和“健康、安全和環(huán)境工作組” 秘書長、中國微米納米技術學會納米科學技術分會常務理事、及北京生物醫(yī)學工程學會常務理事。擔任《中國生物醫(yī)學工程學報》、《北京生物醫(yī)學工程》和《國際生物醫(yī)學工程雜志》的編輯委員會委員。
3. 課題組成員介紹
劉健，博士，研究員，博士生導師，Email：liujian@ibm.pumc.edu.cn; 電話：69156437
1996年畢業(yè)于北京理工大學化工與材料學院，獲高分子材料與工程專業(yè)學士學位。2002年～2009年在日本京都大學高分子化學專業(yè)攻讀碩士、博士學位，主要從事高分子修飾富勒烯衍生物在腫瘤的光動力學治療及腫瘤診斷中的應用，以及有關再生骨組織的分子影像學的研究，獲得京都大學工學博士學位。博士畢業(yè)后在日本京都大學再生醫(yī)科學研究所擔任博士后研究員，從事非病毒高分子載體系統(tǒng)的構筑及細胞基因轉導干細胞的分化誘導的研究。2011年作為海外特聘人才引進中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程系。研究方向為：藥物/基因遞送系統(tǒng)、組織工程與再生醫(yī)學。擔任研究生《生物醫(yī)學工程概論》課程負責人，同時承擔醫(yī)大八年制臨床醫(yī)學專業(yè)《生物醫(yī)學工程》和研究生《納米醫(yī)學概論》課程的部分授課任務。
孟潔，博士，副研究員，碩士研究生導師，Email：mengjie@ibms.pumc.edu.cn; 電話：69156437
2002年畢業(yè)于山東大學醫(yī)學院臨床醫(yī)學專業(yè)，獲得醫(yī)學學士學位；2007年畢業(yè)于北京協(xié)和醫(yī)學院生物醫(yī)學工程學系，獲得理學博士學位。同年進入中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程學系工作。從事納米材料的免疫學效應及其在抗腫瘤治療、引導組織再生中的應用研究。2014年在CMB資助下在美國霍華德醫(yī)學院分子影像中心進修。承擔北京協(xié)和醫(yī)學院八年制臨床醫(yī)學專業(yè)課程《生物醫(yī)學工程》、研究生課程《生物醫(yī)學工程概論》、《納米醫(yī)學》和《生理學的物理分析》的部分授課內容。
 溫濤，博士，助理研究員。Email：went@ibm.pumc.edu.cn; 電話：69156437
 2010年本科畢業(yè)于東南大學生物醫(yī)學工程專業(yè)，2015年畢業(yè)于中國科學院大學國家納米科學中心，獲物理化學博士學位；同年進入中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程系工作，從事納米結構材料設計、制備及其在體外檢測與診斷、分子影像方面的應用基礎研究。在研究生課程《生物醫(yī)學工程概論》和《納米醫(yī)學》中承擔部分授課任務。
孔樺，副主任技師，Email：konghua@pumc.edu.cn; 電話：69156437
 
二、蔣太交課題組
1. 課題組簡介
課題組主要從事計算生物學和系統(tǒng)醫(yī)學方面的研究，研究方向主要包括如下三方面：（1）發(fā)展蛋白質結構預測、基因共進化分析以及生物分子網(wǎng)絡模建等計算生物學新方法；（2）發(fā)展醫(yī)學文本挖掘和醫(yī)學影像數(shù)據(jù)處理人工智能系統(tǒng)；（3）運用大數(shù)據(jù)技術和系統(tǒng)生物學方法，尋找疾病關鍵分子標志物，為疾病分類、早期診斷和治療提供線索。相關研究成果發(fā)表在Cell Host & Microbe、Nature Communications、Genome Research、PLoS Computational Biology、Bioinformatics等國際權威雜志上并申請專利多項。
2. 課題組負責人介紹
蔣太交，中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所研究員/博士生導師、中國醫(yī)學科學院生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)中心主任、蘇州系統(tǒng)醫(yī)學研究所共同創(chuàng)始人和所長助理、中國科學院"百人計劃"和國家杰出青年基金獲得者。
1999年在中國科學院上海生物化學研究所獲得生物化學與分子生物學博士學位；2002年在美國耶魯大學計算機系獲得計算機科學碩士學位；1999-2002年在耶魯大學生物學系從事博士后研究工作; 2003-2004年在麻省理工學院生物學系從事博士后研究工作; 2004年回國擔任中國科學院生物物理研究所研究員，獲得中科院“百人計劃”擇優(yōu)支持；2015年7月被聘為中國醫(yī)學科學院 & 北京協(xié)和醫(yī)學院“協(xié)和學者”特聘教授、中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所和蘇州系統(tǒng)醫(yī)學研究所研究員、第三屆中國人類遺傳資源管理專家組成員。
研究方向為計算生物學和系統(tǒng)醫(yī)學研究，主要包括：發(fā)展蛋白質結構預測、基因共進化分析、生物醫(yī)學大數(shù)據(jù)深度挖掘以及生物分子網(wǎng)絡模建等新技術新方法；結合高通量實驗手段，探究包括傳染病在內的復雜疾病的分子機理；運用系統(tǒng)生物學方法，對疾病進行精細分型和預測預警。相關研究成果發(fā)表在Cell Host & Microbe、Nature Communications、Genome Research、PLoS Computational Biology、Bioinformatics等國際權威雜志上，申請專利多項。
 
三、張唯唯課題組
1.  課題組簡介
課題組致力于研發(fā)適應現(xiàn)代醫(yī)學影像大數(shù)據(jù)特點的計算機視覺、機器學習、人工智能圖像識別方法和應用；提供計算機輔助建模、鑒別、診斷系統(tǒng)的解決方案。以腦神經(jīng)醫(yī)學圖像為主要研究對象，結合多模態(tài)醫(yī)學成像進行形態(tài)測量學的腦神經(jīng)定量研究，探索腦神經(jīng)圖像可定量指標與腦神經(jīng)疾病的關聯(lián)性及其臨床診斷意義。
   2. 課題組負責人介紹
張唯唯，博士。1997-2001年就讀于東北大學信息科學與工程學院，獲生物醫(yī)學工程專業(yè)學士學位。2001-2002年在深圳安科高技術有限公司從事核磁共振工作。2003-2007年在英國牛津大學工程科學系攻讀博士學位，研究心血管核磁共振與實時三維心臟超聲多模態(tài)時序圖像處理，獲得博士學位。博士畢業(yè)后在英國牛津大學工程科學系沃夫森醫(yī)學視覺實驗室擔任助理研究員，從事胸腹部核磁共振和胸部數(shù)字合成圖像分析工作。2010-2011年赴美國賓夕法尼亞大學放射學系生物醫(yī)學圖像分析分部參與腦神經(jīng)發(fā)育與老化相關的圖像處理與分析的博士后研究工作。2011-2015年在東芝醫(yī)療系統(tǒng)（中國）有限公司擔任CT事業(yè)部資深科研專家，先后參與多項動態(tài)容積CT全器官灌注、超低劑量重建、及能譜成像的單中心與多中心研究項目。2015年10月作為引進人才加入中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程系，聘為準入課題組長。
    3. 課題組成員介紹
趙成，衛(wèi)生技師，學歷：碩士研究生
Email：z_cheng@ibms.pumc.edu.cn；電話：010-69156407
 
四、張衛(wèi)奇課題組
        1. 課題組簡介
        課題組研究方向包括以下三個方面：（1）以藥物－細胞成分相互作用為基礎的納米藥物載體設計和應用。（2）多模態(tài)成像納米探針的構建及其在腫瘤分子影像和光動力治療研究中的應用。（3）納米生物材料（藥物載體）的細胞生物學效應。
        2. 課題負責人簡介：
 張衛(wèi)奇，理學博士，副研究員。2004.09-2008.07于湖南師范大學生物技術專業(yè)獲學士學位。2008.09-2013.07于北京協(xié)和醫(yī)學院生物醫(yī)學工程專業(yè)獲博士學位。2014.02-2018.12 在康奈爾大學醫(yī)學院放射醫(yī)學系做博士后研究。2019.02加入中國醫(yī)學科學院基礎醫(yī)學研究所&北京協(xié)和醫(yī)學院基礎學院生物醫(yī)學工程系，任青年課題組長。
        3. 課題組成員介紹
鄧虹，博士，助理研究員。
 
教學工作：
一、  學系承擔的主要課程及建設情況
學系承擔北京協(xié)和醫(yī)學院八年制臨床醫(yī)學專業(yè)本科生《生物醫(yī)學工程》課程的授課任務。近年來，不斷提高課程的國際化和雙語化程度；先后邀請多位國際知名學者為學生進行全英文授課，并與學系教師座談交流教學經(jīng)驗，包括美國猶他大學藥學和藥物化學系主任/生物工程系教授David Grainger博士、美國康奈爾大學醫(yī)學院分子影像創(chuàng)新學院主任童景炫教授（Ching-Hsuan Tung）、京都大學田畑泰彥教授（Yasuhiko Tabata）、中國臺灣國立清華大學邱信程教授等。
授課采用國外原版教材與國內教材相結合，結合臨床應用現(xiàn)狀，從中提煉出適合臨床醫(yī)學專業(yè)和生物醫(yī)學專業(yè)學生學習的內容。為激發(fā)學生的學習興趣并對學習和授課效果進行更有效的考核評價，進行了多次改革。在教材建設方面，在院校教學改革項目支持下，全系教師共同撰寫了適合生物醫(yī)學專業(yè)學生的《生物醫(yī)學工程講義》。
在網(wǎng)絡化建設方面，通過所院教改項目支持開展了醫(yī)學信息學教學建設，包括圍繞生物信息學e-learning為中心的網(wǎng)絡資源建設工作，開展北京協(xié)和醫(yī)學院生物醫(yī)學信息學核心內容制定的研究和評價。通過建設輔助課堂教學的在線教育系統(tǒng)，推動學習和課程管理的網(wǎng)絡服務，增強生物信息實踐教學的參與性、互動性和綜合性，增強學生利用生物信息工具解決科研實際問題的能力。此外還開展了電子技術在生物醫(yī)學中的應用實驗平臺建設工作，用于研究生教學，內容包括：信號檢測、信號數(shù)字化、醫(yī)學圖像三維重建、信號網(wǎng)絡傳輸、仿真實現(xiàn)。
        二、特色教學工作
1. 組織臨床醫(yī)學專業(yè)的本科生參加北京新星杯學生學術論文演講比賽
為了進一步提高學生對生物醫(yī)學工程學科的認識以及學習的主動性，近年來學系組織臨床醫(yī)學專業(yè)的本科生參加了北京新星杯學生學術論文演講比賽。此項活動由北京生物醫(yī)學工程學會主辦，來自北京大學、清華大學、北京航空航天大學、北京協(xié)和醫(yī)學院、北京交通大學、北京理工大學、首都醫(yī)科大學、中國中醫(yī)科學院、北京工業(yè)大學等9個單位的本科生和研究生參加比賽，旨在促進北京市各大高校生物醫(yī)學工程專業(yè)及相關領域科技工作者和學生之間的學術交流，加強青年科技人才隊伍建設，為生物醫(yī)學工程專業(yè)的研究與發(fā)展、為青年科技工作者和學生成長成才搭建一個相互交流、相互促進、共同提高的平臺。北京協(xié)和醫(yī)學院臨床醫(yī)學專業(yè)本科生從第三屆開始參加比賽并取得優(yōu)異成績，2010級劉子源（演講題目：決策樹在臨床中的應用）、2011級孫思進（演講題目：基因工程改造T細胞—腫瘤免疫治療新方法）和2012級張震（演講題目：人工智能助力醫(yī)療健康產(chǎn)業(yè)）分別獲得第三屆、第四屆和第五屆本科生組比賽第一名。2017年在首屆京津冀三地聯(lián)合舉行的首屆京津冀學生演講比賽網(wǎng)上展示中，臨床醫(yī)學專業(yè)2014級本科生張弘哲、黃警與十余名研究生一起參加了預賽，展示了人工智能、人工眼角膜等新技術在臨床中的應用。
2. 接受臨床醫(yī)學和專業(yè)學生在本科階段接觸科研，通過課堂宣講以及與臨床科室的科研合作，學系吸引了多名本科生參加實驗室科研實踐、科研訓練、以及與臨床科室合作開展科研項目。
三、教學組人員
彭屹，研究員，碩士生導師
1985年畢業(yè)于浙江大學生物醫(yī)學工程專業(yè)，獲學士學位；1990年畢業(yè)于中國協(xié)和醫(yī)科大學生物醫(yī)學工程專業(yè)，獲碩士學位。1986年期間在美國倫塞雷爾工學院（Rensselaer Polytechnic Institute）生物醫(yī)學工程系作訪問學者。曾任教育部生物醫(yī)學工程專業(yè)教學指導委員會委員?，F(xiàn)任中國生物醫(yī)學工程學會常務副秘書長。研究方向為生物醫(yī)學信號處理與分析、心臟電生理建模與仿真和智能化醫(yī)學儀器。曾主持和完成國家自然科學基金和北京市自然科學基金項目，并參與國家科技支撐計劃等項目的研究工作。研究論文發(fā)表于IEEE Transaction on Biomedical Engineering和Medical& Biological Engineering & Computing等專業(yè)領域期刊。擔任北京協(xié)和醫(yī)學院研究生院《生理學的物理分析》和《電子技術在生物醫(yī)學中的應用》課程負責人，同時承擔協(xié)和醫(yī)大八年制臨床醫(yī)學專業(yè)《生物醫(yī)學工程》和研究生《計算機應用基礎》的部分教學任務。
代表性論文
1.    潘越,王志剛,張正國,彭屹^*. 正常人短時心率變異性指標在長時序列中的分布特性及其年齡的影響. 中國生物醫(yī)學工程學報. 2019; Vol38(３):291-297.
2.    李晨曦,潘越,王志剛,張正國,彭屹^∗. 以線性參數(shù)模型和信息分解方法評價ＱＴ變異性對心率變異性的響應. 中國生物醫(yī)學工程學報. 2018; 37(３):305-312.
3.    湛萍, 李晨曦, 王志剛, 張正國, 彭屹^*. 直立傾斜引起的心率和血壓的耦合性變化分析. 中國生物醫(yī)學工程學報, 2017; 36(3): 284-292.
4.    Ping Zhan, Chenxi Li, Hongduoer Liu, Yi Peng^*. Reflection of autonomic regulation behaviour using short-term cross-spectral analysis on RR and QT intervals. Computing in Cardiology, 2016; 43: 154-157 ( EI收錄).
5.    劉紅奪兒, 湛萍, 王志剛, 彭屹^*. 以短時心率變異性反映充血性心力衰竭患者自主神經(jīng)活動的改變.中國生物醫(yī)學工程學報, 2016; 35(2): 155-161.
6.    Hongduoer Liu, Ping Zhan, Zhigang Wang, Yi Peng^*. Assessment of autonomic nerve activity by circadian rhythm at different stages after acute myocardial infarction based on Holter data. Computing in Cardiology, 2015; 42: 613-616. ( EI收錄)
7.    Yi Zhu, Xiaolin Yang, Zhigang Wang, Yi Peng^*. An evaluating method for autonomic nerve activity by means of estimating the consistency of heart rate variability and QT variability. IEEE Transactions on Biomedical Engineering, 2014; 61(3): 938-945. (SCI收錄)
8.    Yi Zhu, Xiaolin Yang, Zhigang Wang, Yi Peng^*. Comparative analysis of short-term variability of RR and QT intervals for the assessment of autonomic nerve activity. Computing in Cardiology, 2013; 40: 73-76. ( EI收錄)
9.    Yi Peng^*, Zhongwei Sun. Characterization of QT and RR interval series during acute myocardial ischemia by means of recurrence quantification analysis. Medical & Biological Engineering & Computing, 2011; 49(1): 25-31. (SCI收錄)
10.  Jing Zhang, Yi Peng^*. Assessment of cardiac autonomic state based on RR and QT interval series and symbolic analysis. Computing in Cardiology, 2011; 38: 689-692. ( EI收錄)
11.  李心雅, 許亮, 楊嘯林, 彭屹^*. 全心電生理建模及體表電位標測圖的仿真. 中國生物醫(yī)學工程學報，2011，30（2）:240-249.
12.  張靖, 李心雅, 彭屹^*. 心肌缺血中心率變異性的符號動力學分析. 國際生物醫(yī)學工程學雜志，2010; 33(1): 31-35.
13.  許亮, 孫中偉, 彭屹^*. 基于正向模型仿真的心室異位起搏點定位. 中國生物醫(yī)學工程學報, 2009; 28(3): 377-385.
14.  Yi Peng^*, Liang Xu, Xing Wang. Heart rate variability in myocardial ischemic periods. IEEE Engineering in Medicine and Biology Magazine, 2008; 27(5): 14-19. (SCI收錄).
 
楊嘯林，副教授，碩士生導師
1996年畢業(yè)于首都醫(yī)科大學臨床醫(yī)學專業(yè)，獲得學士學位；2004年畢業(yè)于中國協(xié)和醫(yī)科大學，獲博士學位；同年加入基礎醫(yī)學研究所生物醫(yī)學工程系工作；開展生物醫(yī)學數(shù)據(jù)收集、管理、整合、注釋、分析與挖掘工作，并從事生物醫(yī)學本體應用與建設、生物醫(yī)學數(shù)據(jù)標準化與數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)平臺的開發(fā)。作為骨干成員參與“國家人口與健康科學數(shù)據(jù)共享服務平臺基礎醫(yī)學科學數(shù)據(jù)中心”（http://www.bmicc.cn）的建設和管理，是一系列有影響的數(shù)據(jù)庫——“國民體質與健康數(shù)據(jù)庫”、“中國人心理狀況數(shù)據(jù)庫”、“中國數(shù)字化可視人體數(shù)據(jù)庫”和“MedPortal生物醫(yī)學本體數(shù)據(jù)庫”的主要建設人員。與此同時，作為骨干人員參與科技部精準醫(yī)學研究項目“中國重大疾病與罕見病臨床與生命組學數(shù)據(jù)庫”、國際合作項目“蛋白質組生物大數(shù)據(jù)與標準系統(tǒng)”、 國家科技部科技基礎性工作專項“中國人生理常數(shù)數(shù)據(jù)庫擴大人群調查”和“中國國民健康狀況和基本生理參數(shù)本底調查（2期）”等項目。曾主持及參加國家自然基金項目。
在教學方面，擔任北京協(xié)和醫(yī)學院研究生院《應用生物信息學》和《計算機應用基礎》課程負責人；同時，承擔醫(yī)大八年制臨床醫(yī)學專業(yè)本科課程《生物醫(yī)學工程》和研究生課程《生理學的物理分析》的部分教學任務。主持兩項院校教學改革項目“應用生物信息學課程在線學習管理系統(tǒng)建設”和“重點課程建設——應用生物信息學”；并建設信息學類課程教學網(wǎng)站http://122.70.220.96:81。
代表性論文
1.    Hongjie Pan, Xiaocui Bian, Sheng Yang, Yongqun He, Xiaolin Yang^* and Yuqin Liu^*. The cell line ontology-based representation, integration and analysis of cell lines used in China. BMC Bioinformatics 2019; 20(Suppl5):179:249-264.
2.    Hongjie Pan, Yan Zhu, Sheng Yang, Zhigang Wang, Wei Zhou, Yongqun He, Xiaolin Yang. Biomedical ntologies and their development, management, and applications in and beyond China. Journal of Bio-X Research. 2019:1-7在線發(fā)表.
3.    Zhigang Wang, Wei Liu, Chong Chen, Xiaolin Yang, Yunping Luo & Bailin Zhang. Low mutation and neoantigen burden and fewer effector tumor infiltrating lymphocytes correlate with breast cancer metastasization to lymph nodes. Scientific Reports. 2019; DOI:10. 1038/s41598-018-36319-x.
4.    張寧寧,黃銀,孫偉,邵晨,張本煜,頊華麗, 張揚,張鵬,張力偉,朱偉民,楊嘯林. 人類膠質瘤蛋白質組數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)構建. 醫(yī)學信息學雜志. 2018年第39卷第8期;67-73.
5.    郭靖文, 楊晟, 史涪仁, 邵晨, 張璐璐, 王恒^*, 楊嘯林^*. MedPortal: 面向精準醫(yī)學的生物醫(yī)學本體資源存儲和應用平臺. 中國生物醫(yī)學工程學報, 2017; 36(5): 557-564.
6.    Xiaoyi Tian, Di Chen, Ran Zhang, Jun Zhou, Xiaozhong Peng, Xiaolin Yang^*, Xiuru Zhang^*, Zhi Zheng^*. Quantitative survey of multiple CpGs from 5 genes identifies CpG methylation panel discriminating between high- and low-grade cervical intraepithelial neoplasia. Clinical Epigenetics, 2015; 7: 4
7.    許三崗, 莊永龍, 郝志勇, 單廣良, 楊嘯林^*, 王恒^*. 致病瘧原蟲分子功能注釋二級數(shù)據(jù)庫的構建. 中國生物醫(yī)學工程學報，2012; 31(6): 882-888
8.    高碧霞, 李明喜^*, 劉雪嬌, 蔡建芳, 樊曉紅, 楊嘯林^*, 李雪梅, 李學旺，磁珠分離結合生物質譜分析代謝綜合征早期腎損害尿液蛋白譜. 中國醫(yī)學科學院學報, 2011; 33(5): 511-516
9.    楊嘯林, 張靖, 韓少梅, 張正國^*,朱廣瑾^*. T波形態(tài)學分析心室復極不一致性在黑龍江省人群分布特點. 基礎醫(yī)學與臨床, 2010; 30(9): 912-917
10.  楊嘯林, 張靖, 徐鋮, 王志剛, 李心雅, 韓少梅, 朱廣瑾, 張正國^*. 基于大規(guī)模人群調查的心電數(shù)據(jù)庫的構建. 中國生物醫(yī)學工程學報, 2010; 29(3): 326-330
11.  楊嘯林, 張正國^*. 基于支持向量機預測蛋白質轉導域的研究. 國際生物醫(yī)學工程學報, 2010; 33(4): 205-208.
12.  Xu CL^#, Yang XL^#, Zu SY, Han SM, Zhang ZG, Zhu GJ^*. Association between Serum Lipids, Blood Pressure, and Simple Anthropometric Measures in an Adult Chinese Population，Arch Med Res, 2008; 39(6): 610-617.
13.  Yang XL^#, Xie J, Niu B, Hu XN, Gao Y, Xiang Q, Zhang YH, Guo Y, Zhang ZG^* Structure analysis of the protein transduction domain of human Period1 and its mutant analogs. J Mol Graph Model, 2005; 23(5): 389-394
 
王志剛，講師
2005年畢業(yè)于東南大學臨床醫(yī)學系臨床檢驗專業(yè)，獲學士學位；2008年畢業(yè)于中國協(xié)和醫(yī)科大學生物醫(yī)學工程專業(yè)，獲碩士學位。主要從事生物信息學方向的教學和科研工作。曾主持完成北京協(xié)和醫(yī)學院協(xié)和青年基金“網(wǎng)絡模塊算法預測乳腺癌中的轉錄調控關系”和國家人口與健康科學數(shù)據(jù)共享平臺專項課題“轉錄組測序大數(shù)據(jù)可視化策略研究”的研究任務。目前承擔北京協(xié)和醫(yī)學院研究生院《應用生物信息學》和《計算機應用基礎》課程的部分教學任務。在網(wǎng)絡化教學建設方面，使用自主開發(fā)的組學大數(shù)據(jù)挖掘分析平臺講授生物信息學相關算法和數(shù)據(jù)可視化策略。申請軟件著作權一項。
代表性論文
1.  王志剛，劉偉^∗，應用轉錄組和外顯子組測序分析不同年齡組的膠質母細胞瘤中基因表達與變異的差異。解剖學報，2019;50(1): 9-13.
2.  潘越,王志剛,張正國,彭屹^*. 正常人短時心率變異性指標在長時序列中的分布特性及其年齡的影響.中國生物醫(yī)學工程學報. 2019; 38(３): 291-297.
3.  Zhigang Wang, Wei Liu, Chong Chen, Xiaolin Yang1, Yunping Luo & Bailin Zhang. Low mutation and neoantigen burden and fewer effector tumor infiltrating lymphocytes correlate with breast cancer metastasization to lymph nodes. Scientific Reports. 2018: DOI: 10. 1038/s41598-018-36319-x.
4.  李晨曦,潘越,王志剛,張正國,彭屹^∗. 以線性參數(shù)模型和信息分解方法評價ＱＴ變異性對心率變異性的響應.中國生物醫(yī)學工程學報.2018; 37(３):305-312.
5.  湛萍, 李晨曦, 王志剛, 張正國, 彭屹^*. 直立傾斜引起的心率和血壓的耦合性變化分析. 中國生物醫(yī)學工程學報, 2017; 36(3): 284-292.
6.  劉紅奪兒, 湛萍, 王志剛, 彭屹^*. 以短時心率變異性反映充血性心力衰竭患者自主神經(jīng)活動的改變. 中國生物醫(yī)學工程學報, 2016; 35(2): 155-161.
7.  Cui H, Li N, Li X, Qi K, Li Q, Jin C, Wang T, Duan L, Jiang L, Chen G, Wang Z, Wei C, Yang Y. Tongxinluo modulates cytokine secretion by cardiac microvascular endothelial cells in ischemia/reperfusion injury. Am J Transl Res. 2016; 8(10): 4370-4381.
8.  Hu, Qiang, Zhigang Wang, and Zhengguo Zhang. FSim: A Novel Functional Similarity Search Algorithm and Tool for Discovering Functionally Related Gene Products. BioMed Research International, 2014; 509149. doi: 10.1155/2014/509149.
9.  Y. Zhu, X. Yang, Z. Wang, and Y. Peng. An evaluating method for autonomic nerve activity by means of estimating the consistency of heart rate variability and QT variability. IEEE Trans. Biomed. Eng. 2014; 61(3): 938-945.
10.王志剛, 謝麗芳, 陳鑫, 彭屹, 張正國. 藥物化學結構在線分析系統(tǒng). 藥物生物技術, 2012; 19(2): 153-155.
11.王志剛, 王茜, 陳鑫, 彭屹, 楊嘯林, 張正國. FlexDB: 在線個人健康評估系統(tǒng).醫(yī)學信息學, 2012; 33(2): 18-21.
12.王志剛, 謝麗芳, 陳鑫, 楊嘯林, 張正國. 藥物功能模式聚類，中國生物醫(yī)學工程學報, 2011,30(6):18-23.

北京協(xié)和醫(yī)學院

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